ну в данном случае у тебя
# устанавливаем ключ-переменную для запроса к мемкешу set $memcached_key "default/$uri?$args";
и все! это же касается только memcached. При чем тут реальные файлы?
только лишняя переменная=index.php? в ключе
# устанавливаем ключ-переменную для запроса к мемкешу set $memcached_key "default/$uri?$args";