перестает выводиться сам ресурс (пустой контент)
Кстати да :) Ведь ты ниже перетираешь в цикле переменную $resource :)
Поэтому $modx = & $this->modx — оправдано, а вот с $resource здесь не оправдано. Но где логика позволяет, лучше конечно использовать, так как нагрузку снижает, не делает копию инстанса.