1. Мне не понятно, зачем куча шаблонов? Я понимаю шаблон для главной (потому что часто главная отличается от внутренних и там куча всего), общий шаблон (для большинства документов), и шаблоны для автоматизации (допустим, вывод всех дочерних документов, типа как в новостях и каталогах (разделы)). Все. Обычно даже в магазинах кол-во шаблонов не превышает пяти.
2. По сабжу: вот уже бОльшая часть дела уже сделана. Код выводится на страницу, слайдер работает. Теперь это просто надо разбить по частям. К примеру, там, где перечислены картинки, заменить на блок вывода картинок из документов. Создается раздел этих слайдер-документов (как правило это тип документов Ссылка, и они будут вести на другие страницы сайта), создаешь TV-поле для них, заливаешь для них картинки и формируешь из этого динамический слайдер.
А все это дело вынеси в отдельный блок и используй в шаблоне главной.