Не понимаю, о каких скриптах речь, но compress_js — да, отвечает только за сжатие скриптов в админке (при этом настройка manager_js_zlib_output_compression отвечает за использование php-модуля zlib для этого самого сжатия).
Что касается сжатия html и статики, отдаваемой клиенту (не минификации/обфускации, а именно gzip-запаковки ), то да — никаких других настроек в modx нет (например, отвечающих за сжатие отдаваемого html). И это логично, т.к. в общем случае сжатию должны подвергаться не только html, но и внешние (отдельно подключаемые) стили со скриптами и некоторые прочие форматы данных — за них modx не отвечает.